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PubMed包含来自MEDLINE、生命科学期刊和在线书籍的3400多万篇生物医学文献引用。引文可能包括PubMed Central和出版商网站的全文内容链接。

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PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的生物医学文献免费检索系统,包含1966年以来的来源于70多个国家和地区的4000多种生物医学期刊的文献。PubMed包含的文献不局限于MEDLINE,还包括其他一些未被MEDLINE收录的文献。

PubMed文献检索详细攻略

一、PubMed检索规则

1.布尔逻辑词

用于表达检索词与检索词之间的逻辑关系的运算符。常见的逻辑关系词有3个:AND、OR、NOT

比如:A AND B意思是:检索同时包含检索词A和B的文献;
A OR B意思是:检索包含A或B或同时包含检索词A和B的文献;
A NOT B意思是:检索包含A但不包含B的文献;
注意事项:

  1. 检索运算符AND、NOT、OR必须大写;
  2. 默认检索词之间的”空格”为”AND”检索;
  3. 布尔运算是从左至右运行,可以通过括号来改变运算顺序;

2.截词符
截词检索是取检索词的一部分,加上截词符号一起进行检索,这种方式解决检索词的单复数、词尾变化、同一词的拼法变异等问题。

PubMed支持截词检索,常用的截词符号为:
* 代表零或一个以上字母; 代表零或一个字母。

截词检索只针对单个词,而对词组无效,如:bacter*, 可以检出以bacter为词干的单词bacteria、bacterium等最多600个单词。

截词符既可以放在检索词之前,也可以放在词语中间,或词语最后。

3. 限定词

限定检索通过将检索词限定在一个或多个特定字段中,来减少搜索结果。

常用的限定检索符号为:双引号"",其表示强制检索,这个跟谷歌、百度等搜索引擎中的强制检索是一样的。

跟截词符不同,使用双引号进行强制检索可以应用于某个单词,也可以用于词组。

注意:所有的检索符号都必须是英文状态下输入。

4.检索字段标识符

可以在检索词后面加上字段标识符来指定检索词的含义,从而实现精确检索。比如说检索具体某一篇文献,在文献标题后加[TI]可以限定检索文章标题。

常用的检索字段标识符如下:

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二、PubMed检索方式

1.自由词检索

自由词检索即是输入与检索信息相关的任意词(组),而主题词检索则是规范化的检索语言,它对文献中出现同一概念词汇的书写形式具有严格的规范控制。

需要注意的是,PubMed具有智能检索的功能,对输入的每一个自由词它将会自动进行自由和规范主题词双重检索。

举个例子:如果我们想在数据库中搜索“维生素 H” 相关文献,直接在「All Fields」中输入自由词「vitamin H」。此时,PubMed的实际检索式为:“biotin”[MeSH Terms] OR “biotin”[All Fields] OR “vitamin h”[All Fields]。

Biotin 就是 vitamin H 的规范化主题词。也就是说,PubMed自动增加了主题词的检索。

2.主题词检索

自由词检索往往会由于初步检索词汇的宽泛,导致输出结果过多,不方便整理。这时我们可以使用主题词进行检索,但是很多词语我们往往不知道他的规范主题词是什么,这时候就可以借助主题词数据库进行检索。

新版主题词数据库的进入方式:

在 Pubmed 主界面的右下角选择「MeSH Database」→「NLM MeSH Homepage」→「Browser Instructions」→ 「MeSH Browser 」,当然,嫌麻烦也可以直接从下图的网址(https://meshb.nl.nih.gov/search)直接进入。

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比如我们继续以「vitamin H」搜索,就会出现下方图片的检索结果,发现它的规范主题词是「Biotin」。

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3.作者姓名检索:

按照姓+名缩写(不用标点)的格式键入作者姓名,如:smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第一个字母可用大写也可用小写,姓前名后,姓用全称,名字一般用缩写。考虑到作者姓名的不同形式,PubMed采用自动转换功能进行作者姓名检索,如:smith j将检索成smith ja, smith jb, smith jr等。精确检索:可以用双引号将作者名引起来,再加作者字段限定[AU],如:“smith j”[au],这样可避免PubMed自动转换,实现精确查找。

4.期刊名称检索:

利用文献「来源期刊名称」检索时,刊名既可以是全称,也可以是 MEDLINE 刊名标准缩写。

但需要注意的是:

  • 有些期刊名同时也是主题词,比如:Cell。所以这样的期刊名称在搜索时需要加上刊名标识符 [ta] 进行限定。
  • 刊名中带有括号的,可以将括号省略不输入。
  • 最后一招,还可以通过国际标准连续出版物代码,是的,没错,就是使用看起来很眼熟但是不知道全称的 ISSN 代码来查询,这样可以准确的查询到绝大多数期刊。

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